Esta clase de medicamentos modulan la reacción del sistema inmunológico para evitar la inflamación continua. Son por lo general usados en personas que no han tenido éxito con los aminosalicilatos y los corticosteroides. Pueden ayudar a reducir o eliminar la necesidad de tomar corticosteroides. También su efectividad puede ayudar a mantener la remisión en personas que no han respondido a otros medicamentos. El efecto de los inmunomoduladores puede tomar varios meses (1 a 3 meses), por lo cual hay que comenzarlas y esperar su efecto.

Ejemplos de inmunomoduladores:

• Azatioprina (Imuran®),
• 6-Mercaptopurina (Purinethol®/ Varimer®), y
• Metotrexato.

Estos medicamentos tienen unas serie de efectos colaterales, algunos bastantes serios, para lo cual el paciente debe estar bien informado y supervisado por el médico tratante.